Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc4Q9QZD4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms