Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC2

Plxnc1, Plexin-C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnc1Q9QZC2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnc1Q9QZC2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnc1Q9QZC2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms