Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms