Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rdh11Q9QYF1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rdh11Q9QYF1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rdh11Q9QYF1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rdh11Q9QYF1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rdh11Q9QYF1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rdh11Q9QYF1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rdh11Q9QYF1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rdh11Q9QYF1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh11Q9QYF1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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