Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tomm40Q9QYA2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms