Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx4Q9QY61 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms