Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms