Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms