Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copg2Q9QXK3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms