Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms