Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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