Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Homer2Q9QWW1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms