Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chaf1aQ9QWF0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chaf1aQ9QWF0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms