Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms