Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcea2Q9QVN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms