Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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