Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms