Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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