Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms