Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms