Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thsd1Q9JM61 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thsd1Q9JM61 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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