Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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Rabgef1Q9JM13 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Rabgef1Q9JM13 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Rabgef1Q9JM13 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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