Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms