Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms