Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FancaQ9JL70 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FancaQ9JL70 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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