Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms