Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms