Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrac1Q9JKP8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms