Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms