Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mrpl39Q9JKF7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms