Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms