Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx3Q9JKB3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms