Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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