Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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