Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ccdc86Q9JJ89 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc86Q9JJ89 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc86Q9JJ89 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc86Q9JJ89 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc86Q9JJ89 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc86Q9JJ89 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc86Q9JJ89 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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