Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpf2Q9JJ80 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpf2Q9JJ80 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms