Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms