Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1fQ9JIS7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1fQ9JIS7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms