Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sv2aQ9JIS5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms