Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc6l2Q9JIM3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms