Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms