Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pus3Q9JI38 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pus3Q9JI38 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms