Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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