Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
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Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
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Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
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Rb1cc1Q9ESK9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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Rb1cc1Q9ESK9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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Rb1cc1Q9ESK9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
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Rb1cc1Q9ESK9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
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