Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Usp29Q9ES63 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms