Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms