Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb3Q9ERD7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms