Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap29Q9ERB0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms