Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tfip11Q9ERA6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms