Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn4aQ9ER60 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms